奕柱堂由毕业于耶鲁大学建筑系的美国建筑师亨利·墨菲设计，他还设计过清华大学（扩建）、燕京大学、湖南雅礼大学沪江大学的校园。

    该建筑为混凝土结构，仿中国古建筑中的木柱造型，用铁件制造中国式的花格窗。扩建后，于右任先生题书"仙舟图书馆，草书难认，经常被误读为"傻瓜图书馆"。有学生就此写出一幅对联明志："宁去傻瓜馆，不入百乐门"，以表达自己苦读的决心。