交通大学历来重视学校办学成就和历史文化的传承与展示。早在1931年，学校就在徐汇校区老图书馆成立了“南洋史料室”，收藏了关于本校的史料达数千件，成为了校史博物馆的前身。
1996年4月8日，为迎接交大百年校庆，由学校档案馆牵头筹建，一座全新的校史博物馆在徐汇校区老图书馆正式建成并对外开放，时任总书记和国家主席的江泽民学长亲自题写了馆名。2003年，校史博物馆成为上海市爱国主义教育基地，后又入选了全国博物馆名录。
25年来，先后有百余万观众入馆参观，徐汇校区的校史博物馆成为学校历史文化的重要宣传窗口。近年来，随着学校办学重心向闵行校区转移，2016年学校120周年校庆之际，结合文博楼奠基，新校史博物馆开始启动建设。
