特别值得一提的是，方塔能屹立千年而不倒，与其科学而巧妙的构造是分不开的。首先，在方塔塔体中，木材用料极多，除外部的楼梯、平座、塔檐、斗拱外，塔体内每层还设有木箍三道。这种做法在建筑中是被禁止的，因为建筑结构中（砖、石等材料间）不准夹有木质，因为木质易腐会造成建筑松垮。但方塔所有留存木材（指宋代原物），都没有虫蛀、腐朽，连白蚁也没有，这是一个奇迹。抗日战争时，日军的炸弹在方塔旁爆炸，却没有把方塔炸毁，这又是一个奇迹。据同济大学陈从周、鲁宾杰两位教授分析，木材肯定经过了防腐柔韧处理，千年不腐，炮轰不倒，肯定与之有关。
